Часть первая. Балто. История о нем стала Легендой.

Америка. Штат Аляска, Ном. Зима 1925 год.
Балто - полукровка. Его отец был лайкой (хаски), а мать - волчица. Из-за его диких предков, в городе его избегают люди и насмехаются собаки. Балто живет на берегу моря, на старом корабле, вместе со своим приемным отцом и наставником - полярным русским гусем Борисом и двумя медвежатами Лаком и Маком, которые часто там бывают, ибо считают Бориса родным дядей. Балто остался сиротой, отца и не помнит, только маму. Волчонком он ее потерял и тогда же Борис взял его под свое крыло. От отца Балто передалась огромная страсть к гонкам, с чего и начинается мультипликационная часть мульт фильма....
Стил - первый пес в городе. Чистокровный и самоуверенный ездовой хаски всегда приходит первым во всех гонках, но всегда приходит честным путем. Однажды во время очередной гонки его не специально унизил Балто, обогнав Стила. А дело было вот в чем - единственная, кто хорошо относился к Балто - была девочка Рози. У нее также была самая красивая лайка в городе - Дженна, которая нравилась всем псам и Балто не был исключением. Тогда, на гонке, у Рози сорвало любимую шапку, подаренную утром ее родителями. Шапка упала прямо на трассу, где должна была промчаться ездовая упряжка. Вот Балто и сыграл в благородство, "вырвав" шапку из под лап Стила. Этого пес ему стерпеть не смог, особенно после того, как заметил отношения Дженны к нему и к Балто, которое заметно отличалось. Не удивительно, что Стил вечно находил предлог подоставать Балто вместе с верными подданными - Никки, Калтагом и Старом, которые впрочем не всегда одобряли своего босса.
Случилось непоправимое - в Номе, где проживали герои началась эпидемия дифтерии и как на зло, лекарств нигде не было, а погода стала еще хуже. Ближайшими соседями у которых была сыворотка  оказался Анкоридж, находящийся далеко от Нома. И все бы обошлось, да вот только ледяное море закрыло путь кораблям, а сильные метели не позволяют лететь. Выход один - отправить лекарство в Ненана где заканчивалась железная дорога, а дальше - на ездовых собаках.
В городе выбирали лучших из лучших. Балто, который решил доказать всем, что он тоже может помочь всем, в том числе и хозяйке Дженны - Рози, тоже принял участие в гонке. Несмотря на все каверзы собак, полуволк пришел первым, побив все рекорды. Люди ошеломленные таким результатом, решают, что Балто можно дать шанс, но из-за проделок Стила, они решают, что это опасно. Решено - в Ненана едет упряжка Стила. Дженна искренне соболезнует Балто и желая помочь и поддержать его, наталкивается на его болючий взгляд. Балто убегает на корабль.
Упряжка Стила благополучно добралась до Ненана. В Номе с радостью ожидают его возвращения. Один Балто борется с чувствами. С одной стороны чем быстрее прибежит Стил, тем больше шансов для малышей, но с другой - чем быстрее он вернется, тем скорее примется за старое. К горькому удивлению всех упряжка Стила заблудилась где-то в горах... Балто, однажды тайком подслушав беседу собак, узнал, что вторую упряжку посылать рискованно, а если Стил не вернется, то многих малышей не станет... Балто потрясен этой новостью. Проходя мимо мастерской, он слышит звук молотка, удивившись, что в такое позднее время делают сани, полуволк заглядывает во внутрь и видит детские гробы... Весь город посерел. Надежда исчезла. Балто решил посмотреть как там Рози и с болью замечает, что ей все хуже.
Он решает самостоятельно найти упряжку. В его приключениях его сопровождают верные друзья - Борис, Лак и Мак. По дороге он отмечает свой путь сдертой на деревьях корой. Пройдя в горные леса, они наталкиваются на шатуна-гризли. Балто, защищая друзе, бросается на медведя, но вскоре сам едва не погибает, на выручку поспевает Дженна. Медведь отбрасывает ее в сугроб, но это дало Балто несколько времени, чтобы подняться. Они с медведем, оказываются на льду, а затем и под ним. Дженна и остальные в отчаянии. Тут медвежата, которые искренне верили, что не умеют плавать, ныряют в воду и вытаскивают Балто. Его отогревает своим теплом Дженна. Тогда он замечает, что она ранена. Решив не рисковать жизнями близких, он отправляет их обратно домой. Дженна на счастье отдает ему свой платок, а Борис поучает "Собака одна такой путь пройти не сможет... Но, может это сможет сделать волк?" (с) - это первая ссылка на то, кого на самом деле больше в Балто - собаки или волка.
Балто отправляется дальше один и вскоре находит потерянную упряжку. Выясняется, что собаки не знают дороги, а погонщик без сознания. Балто рассказывает как он их нашел, и что знает путь обратно. Обрадованные собаки готовы принять его помощь. Все кроме Стила. Тот, увидев Дженнын платок на шее Балто, понял, кого предпочла первая лайка Нома, и взбесившись, набрасывается на Балто. Несмотря на сильные удары, тот кажды раз поднимается. Разъяренный пес хватает упирающегося Балто за платок и тащит к обрыву, но платок развязывается и с обрыва падает Стил.
Собаки с готовностью предлагают Балто место предводителя. Тот с удивлением и радостью принимает приглашение, и выводит стаю. Стил, решил отомстить Балто, и погнав другим путем, на лесной развилке пометил все деревья тем же способом, что и Балто, после чего убегает в Ном. Балто же ходит кругами, понимая, что не помнит точную дорогу. Испугавшись, он гонит вперед, в надежде вырваться из оков круга. Ему это удается - свора едва успевает затормозить на обрыве. Лекарство вот-вот упадет. Балто выскакивает из упряжки и ловко хватает лекарство, но вместе с ним летит вниз. Очнувшись, Балто решает что все потеряно - он сорвался высоко и лекарства явно разбито, и все из-за него. В этот момент к нему приходит белоснежная волчица (во второй части как выясняется - дух Энаи) и посмотрев на него, удаляется. На следу остается четкий отпечаток волчьей лапы. Балто вспоминает слова Бориса и несмело опускает свою лапу в этот след. Она идеально вписывается (вторая ссылка на волчью натуру Балто) и поняв кто он на самом деле, Балто громко воет, как волк. Дух волчицы возвращается и поддерживает его. После этого Балто видит, что ящик с вакциной цел и лежит в сугробе. Собрав всю силу, он хватает ящик за веревку и тащит его наверх. Там его встречают удивленные и радостные собаки. Теперь Балто знает путь. Они проходят самым коротким, но и самым опасным путем, по ледяному мосту, по лавине и по пещере с падающими метровым сосульками.
В это же время в Номе возвращается Стил и рассказывает историю о том, что все собаки погибли, вместе с человеком, а он один тащил лекарство, а затем появился Балто, который напал на него и пытался отобрать ящик, вследствие чего он вместе с лекарствами тонет под льдом, перед смертью отдав Стилу платок Дженны. Все собаки ему верят и восхищаются его смелостью. Все кроме Дженны, которая обвинила Стила во лжи. Все списывают это на шок. Сама же Дженна уверена, что Балто жив, как и остальные, и вместе с лекарствами мчит домой. На это не надеяться ни одни люди в городе. Фонарь надежды потух, как и свет во всех окнах. Героев никто не ждет. Понимая, что так Балто не найдет пути домой, рыжая хаски проделывает его же фокус с "северным сиянием", которое он делал с помощью разбитых бутылок. Город освещает это сияние. Друзья Балто грустят, считая, что он погиб, но неожиданно слышат волчий вой, такой знакомый и родной. Услышав собачье-волчье гавканье и вой, люди повключали свет и выбежали на улицы. На фоне холма появилась упряжка с лекарством! При чем упряжкой руководил Балто, а не Стил, собаки или же погонщик. Люди гладят Балто и называют его своим героем. Лекарство привезен вовремя и дети приходят в себя. Рози благодарно обнимает его "Без тебя, я бы пропала" - шепчет девочка своему спасителю. Своему спасителю рада и Дженна. От переполнявших их чувств, они впервые целуются. Балто понимает, что первая лайка города выбрала именно его - полукровку в свои мужья. Стар предложил поставить Балто памятник и это был первый случай, когда его идею поддержали.
Часть вторая Балто. В поисках волка

Америка, штат Аляска, Ном. Весна 1925 год -весна 1926.
После событий первой части, Балто и Дженна стали семьёй и у них родились шестеро щенков. Пять из них очень похожи на свою мать, в то время как один щенок, его назвали Алу (англ. Aleu), явно выделяется среди всех, тем что похож на отца. Когда они достигают восьми недель, всех щенков разбирают новые хозяева, но, к несчастью, никто не хочет брать Алу. Алу остается с отцом. Год спустя, она чудом спасается от охотника, принявшего её за волка, после чего Балто приходится рассказать ей всю правду о её волчьем наследии. В гневе и печали, она убегает, надеясь найти своё место в этом несправедливом мире.
В то же самое время, Балто боролся со странными снами о вороне и стае волков. Он не может понять то, что эти сны означают, но когда Алу не возвращается на следующий день, он мчится на поиски, чтобы найти ее и вернуть домой.
В это время его друзья, русский гусь Борис и два белых медведя Мак с Лаком, надеются найти Балто, но они остановлены какой-то неизвестной силой. Вскоре они понимают, что отец должен найти её самостоятельно. Алу нашла убежище в пещере, там она встречает полёвку по имени Муру (англ. Muru), которая объясняет Алу, что быть наполовину волком не настолько плохо. Она учит её, что у всех есть «дух пути». После пения песни, «Кто Вы?», оказывается, что Муру и есть «дух пути» для Алу.
Вскоре Балто находит дочь, но внезапно на них нападает медведь. Им удаётся спастись, благодаря Алу. Балто уговаривает дочь вернуться домой, но она не хочет возвращаться, пока не узнает, кто она. Вскоре они встречают стаю волков во главе со старым мудрым волком Нава. Он сообщает, что однажды стая будет во главе с новым лидером, «тот, кто волк, но не знает об этом». Все думают, что это Балто. Однако, Ниджу, молодой волк с его тремя последователями (Нук, Як, и Сумак), надеются, что именно Ниджу будет следующим лидером, так как он сильнее, чем старый Нава.
Наступает день, чтобы идти на другой берег за пищей, через большое море, используя части льда как мост, во главе с Балто. Внезапно Нава падает в воду, Алу рвётся спасти его, но сталкивается с Ниджу, который готов убить старого лидера и всех, кто ему помешает. Балто бросает стаю, чтобы спасти его дочь. Стая уплывает на льдине, без лидера. Нава, из-за старости, уже не может плыть так, как раньше, а Ниджу показывает свою боязливость, когда Балто просит его плыть к стае. Балто хочет помочь стае, но Алу понимает, что она нашла свой путь. Она уплывает к стае, чтобы стать её лидером. Балто держит свой путь назад к Ному, а ворон показывает свою истинную форму как великий белый волк, Энаю, мать Балто.
Часть третья. Балто. Крылья перемен/Ветер перемен

Америка, штат Аляска, Ном. Весна 1926 года.
Балто приводит на горную вершину Дженну, чтобы показать ей новое чудо. Внезапно с ревом мимо них проносится … самолет. Сын Балто, Коди, вырос и получил место в упряжке собак, доставляющих почту. Коди недоволен работой упряжки, но они всего лишь развозят почту, а не спасают город, как его отец. Тем временем русский гусь Борис начинает свой день с утренней ванны. Его замечает роскошная гусыня Стэлла, прилетевшая в Ном провести свой весенний отдых. Она предлагает Борису показать ей местные достопримечательности и полетать с ним на закате. Борис попадает в сложную ситуацию…
После встречи со Стэллой Борис со всех лап бежит к Балто за помощью. Он говорит, что у него свидание с прекрасной гусыней, но он не летает, потому что боится высоты. К Балто приходит идея о том, как избавить друга от страхов и пытается помочь ему преодолеть комплекс. Однако все его попытки не приводят к успеху. Мэл и Дипси, из упряжки собак доставляющих почту, узнают ужасные новости — теперь почту будут доставлять самолетом. Через некоторое время было объявлено соревнование, чтобы выяснить, кто доставит почту быстрее. Лидером упряжки становится Балто.
У стартовой черты появляется Борис, который просто в восторге от своей идеи, соврать Стэлле о том, что у него повреждено крыло. Видя, что ее просто обманули, Стэлла загоняет Бориса на борт самолета. Дан сигнал, ознаменовавший начало гонки. Самолет летает куда быстрее, чем могут бежать собаки, и упряжка Балто приходит в Вайт Маунтин с небольшим опозданием. Но Балто не намерен сдаваться, и гонка продолжается. Начинается снегопад и летчик теряет контроль над машиной. Самолет падает в глухой лес. Упряжка приходит к финишу первой.
Несмотря на свою победу, Балто беспокоится о судьбе Дюка, пилота. Он так и не пришел на финишную черту. Из слов Мака и Лака Балто делает вывод, что самолет потерпел крушение и решает отправится на его поиски. Он обращается за помощью к почтовым собакам, но они не хотят помогать «врагу». Коди также отказывается помочь отцу. На пути из города, Балто догоняет Стэлла, которая рассказывает о том, что Борис был на борту разбившегося самолета… Компания друзей отправляется в путь. Температура падала, Мак и Лак играли в чехарду, Лак прыгнул на непрочный выступ горы, и они втроем с Балто падают в бурлящий поток.
Друзья выбираются на сушу и продолжают свой путь. Стэлла находит Медвежью Гору, у которой разбился самолет и компания устремляется к месту крушения. Им удается отыскать Бориса и Балто отправляет друзей отнести его в Ном, а сам остается, помочь Дюку. Когда они вдвоем пересекают горный мост, он рушится. Жизнь летчика и собаки висит на волоске. Коди и его команда приходят на помощь как раз вовремя.
После того как Дюк был спасен, Коди выступил в роли лидера упряжки, а свой новый самолет Дюк называет в честь Балто, собаки которая спасла ему жизнь